鲤鱼三、四核苷酸重复微卫星座位的筛选及特征分析*

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摘要采用磁珠富集法结合放射性同位素杂交法分离出鲤鱼(Cyprinus carpio)三、四核苷酸重复的微卫星阳性克隆1248个。对其中的384个克隆进行测序分析，共得到微卫星序列325个，其中完美型244个（75.08%），非完美型59个（18.15%），混合型22个（6.77%）。依据得到的微卫星序列，用Primer 3软件在线设计并合成引物145对，检测结果显示71.43%（80对/112对）的引物在野生个体间表现出多态性，等位基因数在3~12之间，多态信息含量在0.2109~0.8607之间，80%的位点处于高度多态水平。对群体的遗传结构评估结果显示，四核苷酸重复的微卫星标记在黑龙江鲤野生群体表现出的多态性水平（PIC=0.7740）高于三核苷酸重复（PIC=0.5161）和双核苷酸重复（PIC=0.49），适用于群体间遗传差异分析和遗传连锁图谱的构建。

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关键词 ：鲤鱼, 微卫星, 富集文库, 三核苷酸和四核苷酸重复

Abstract：采用磁珠富集法结合放射性同位素杂交法分离出鲤鱼(Cyprinus carpio)三、四核苷酸重复的微卫星阳性克隆1248个。对其中的384个克隆进行测序分析，共得到微卫星序列325个，其中完美型244个（75.08%），非完美型59个（18.15%），混合型22个（6.77%）。依据得到的微卫星序列，用Primer 3软件在线设计并合成引物145对，检测结果显示71.43%（80对/112对）的引物在野生个体间表现出多态性，等位基因数在3~12之间，多态信息含量在0.2109~0.8607之间，80%的位点处于高度多态水平。对群体的遗传结构评估结果显示，四核苷酸重复的微卫星标记在黑龙江鲤野生群体表现出的多态性水平（PIC=0.7740）高于三核苷酸重复（PIC=0.5161）和双核苷酸重复（PIC=0.49），适用于群体间遗传差异分析和遗传连锁图谱的构建。

Key words：鲤鱼微卫星富集文库三核苷酸和四核苷酸重复

收稿日期: 2009-01-05

通讯作者: 孙效文

引用本文:

鲁翠云 ¹,毛瑞鑫²,孙效文³,梁利群⁴. 鲤鱼三、四核苷酸重复微卫星座位的筛选及特征分析*[J]. , 2009, 17(6): 979-987.

链接本文:

http://journal05.magtech.org.cn/Jwk_ny/CN/ 或 http://journal05.magtech.org.cn/Jwk_ny/CN/Y2009/V17/I6/979