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| SCoT分子标记在猕猴桃遗传多样性分析与变异鉴定上的应用 |
| 陈伯伦1,张 晋2,黄继魁3,黄诚梅3,周秋娟3,陶 伟3,唐娟3 |
1. 广西农业科学院园艺研究所
2. 广西农业科学院成果转化处
3.
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| Application of SCoT Markers on Genetic Diversity Analysis and Variation Identification of Actinidia |
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摘要 本研究以17份猕猴桃(Actinidia)品种(系) (其中2份‘红阳’变异系、1份‘金桃’变异系)为材料，采用目标起始密码子多态性(start codon targeted polymorphism, SCoT)对其遗传多样性和变异进行分析。结果表明，优化好适宜于猕猴桃SCoT-PCR反应体系上，从64条引物中筛选出42条引物对17份猕猴桃材料扩增出487条清晰的条带，其中扩增出的多态性条带为470条带，平均多态性比率为95.1%。17份猕猴桃材料之间的遗传距离范围在0.153~0.693，平均值为0.492。变异株‘桂乐1号’、‘桂乐2号’与对照‘红阳’的遗传距离分别为0.276、0.299，‘金桃’变异与‘金桃’的遗传距离为0.539，3个变异株系均与对照有一定的亲缘关系与遗传距离。聚类分析表明，在遗传距离为0.460的水平上，可以将17份猕猴桃材料分为4组。‘桂乐1号’、‘桂乐2号’与对照‘红阳’归为第Ⅲ组，‘金桃’变异与对照‘金桃’则未能聚为同一组有待于进一步研究。
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| 关键词 ：
猕猴桃,
遗传多样性,
亲缘关系,
变异鉴定,
SCoT分子标记技术
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| Abstract：我国猕猴桃(Actinidia)种质资源极其丰富，可为猕猴桃遗传改良和资源利用提供广泛的背景材料，而从实生苗群中筛选变种是猕猴桃新品种培育途径之一。本研究以17份猕猴桃品种(系)(其中2份红阳变异系、1份金桃变异系)为材料，采用目标起始密码子多态性(start codon targeted polymorphism, SCoT)对其遗传多样性和变异进行分析。结果表明，基于优化后的适宜于猕猴桃SCoT-PCR反应体系，从64条引物中筛选出42条引物对17份猕猴桃材料扩增出487条清晰的条带，其中多态性条带为470条带，平均多态性比率为95.1%。17份猕猴桃材料之间的遗传距离范围在0.153~0.693，平均值为0.492。变异株桂乐1号、桂乐2号与对照红阳的遗传距离分别为0.276和0.299，金桃变异与金桃的遗传距离为0.539，3个变异株系均与对照有一定的亲缘关系与遗传距离。聚类分析表明，在遗传距离为0.460的水平上，可以将17份猕猴桃材料分为4组。桂乐1号、桂乐2号与对照红阳归为第Ⅲ组，金桃变异与对照金桃则未能聚为同一组。SCoT分子标记可以对猕猴桃性状变异进行初步鉴定，为进一步开展变异新品种的早期鉴定和保护提供技术参考，以及为猕猴桃种质资源遗传多样性分析及其分类提供理论支持。 |
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收稿日期: 2017-05-23
出版日期: 2018-01-01
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通讯作者:
张 晋
E-mail: zhangjin0529@gxaas.net
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| [1] |
孙瑞 王桂霞 常琳琳 孙健 董静 钟传飞 石琨 张运涛. 草莓分子标记技术发展与应用[J]. , 2018, 26(9): 1588-1600. |
| [2] |
朱华平 苏换换 马冬梅 黄樟翰. 华南鲤选育品种与地方品种的遗传多样性比较分析[J]. , 2018, 26(8): 1371-1381. |
| [3] |
张思妮 王震 赵丹阳 夏雪娇 翟晓光 张拓 杨二航 丁勤 马翎健. 人工合成小麦农艺性状与SSR标记的关联分析[J]. , 2018, 26(4): 564-575. |
| [4] |
高敏霞 冯新 赖瑞联 胡艺贤 陈文光 吴如健 陈义挺. 米良1号猕猴桃漆酶基因的克隆与表达分析[J]. , 2018, 26(1): 65-76. |
| [5] |
张艳杰 沈凤英 许换平 李亚宁 刘大群. 灰葡萄孢菌多样性研究进展[J]. , 2017, 25(6): 954-968. |
| [6] |
陈义挺 赖瑞联 程春振 冯新 屈蒙蒙 刘萍元 陈文光 吴如健. 猕猴桃果实软化过程中AcPG基因的克隆与表达[J]. , 2017, 25(2): 205-213. |
| [7] |
郝荣超 王国华 梁菲菲. 中国南部和西北地区山羊mtDNA D-loop区遗传多样性及群体分化[J]. , 2017, 25(2): 258-266. |
| [8] |
唐修君 贾晓旭 樊艳凤 高玉时 唐梦君 陈大伟 张小燕 陆俊贤 韩威. 基于线粒体D-loop区四个鸡种DNA条形码和品种鉴定[J]. , 2017, 25(10): 1653-1660. |
| [9] |
杨恒 周天华. 乌头微卫星引物开发及遗传多样性研究[J]. , 2017, 25(1): 58-66. |
| [10] |
陶争荣 徐小钦 沈军达 李丽 曾涛 杜雪 董仕海 卢立志. 6个野鸭群体的遗传多样性及其与绍兴麻鸭的亲缘关系分析[J]. , 2016, 24(8): 1173-1180. |
| [11] |
刘刚 杜玲 陆健 冯海永 韩旭 何丽 哈福 刘丑生. 中国西南地区主要地方绵羊Cytb基因遗传多样性及系统进化的研究[J]. , 2016, 24(5): 678-688. |
| [12] |
邓艳凤 田忠玲 郑经武. 基于线粒体COII-LrRNA基因对肾形肾状线虫种内群体的遗传多样性分析[J]. , 2016, 24(4): 593-599. |
| [13] |
王斌 昝林森 余横伟 刘红 殷林 胡晓一 刘大清. 秦巴山区黄牛群体的微卫星DNA遗传多样性[J]. , 2016, 24(2): 233-244. |
| [14] |
孟亚雄 张海娟 马小乐 王育才 汪军成 司二静 任盼荣 杨轲 张京 王化俊. 89份大麦遗传多样性分析及其网斑病抗性位点相关SSR标记筛选[J]. , 2016, 24(12): 1820-1830. |
| [15] |
要燕杰 吴丹 董剑 赵万春 陈良国 石引刚 高翔. 我国部分冬小麦品种(系)遗传多样性、群体结构和连锁不平衡分析[J]. , 2015, 23(7): 863-875. |
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