猪源冠状病毒纤突蛋白基因的克隆与特征
李建强
兰州市城关区徐家坪1号中国农业科学院兰州兽医研究所国家重点实验室; 甘肃农业大学动物医学院
Cloning and characterization analysis of spike protein gene of porcine Coronavirus
摘要 摘要:对猪源冠状病毒PEDV DX株纤突蛋白基因进行了克隆与测序。结果表明该基因核苷酸序列长为4152 nt, 推导氨基酸序列为1383aa，与比较毒株氨基酸同源性都在90%以上。系统发生树分析结果表明，比较毒株可分为3个基因群，而且每个群的毒株均来自同一个国家。利用生物软件分析结果表明PEDV发生着微小的变异，尤其在韩国变异明显，而DX株与中国JS-2004-2株亲缘关系很近。
Abstract ：Abstract: The spike protein gene of porcine epidemic diarrhea coronavirus (PEDV) DX strain was cloned and sequenced. The results showed that the nucleotide sequence of the gene was 4152 nt in length and encoding a protein of 1383 aa, the homology of amino acids between it and other PEDV strains exceeded 90%. The results of phylogenetic tree analysis showed all the reference PEDV isolates could be divided into 3 genetic groups and the isolates in the same group came from the same country. Bio-soft analysis showed that PEDV muting slowly, especially in Korea, DX strain and JS-2004-2 strain have a closed relationship.
收稿日期: 2006-12-18
通讯作者:
李建强
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