番鸭呼肠孤病毒ZJ99株σC基因的序列分析及其在大肠杆菌中的表达
余旭平;何世成;朱军莉;金俊杰;郑新添
浙江大学动物科学学院,杭州310029
Sequence Analysis of the σC Gene of Muscovy duck reovirus ZJ99 Strain and Its Expression in Escherichia coli
YU Xu-ping;HE Shi-cheng;ZHU Jun-li;JIN Jun-jie;ZHENG Xin-tian
Animal Science College, Zhejiang University, Hangzhou 310029, China
摘要 参考已发表的番鸭呼肠孤病毒(Muscovy duck reovirus, mDRV)的S4序列,自行设计1对扩增σC基因的引物,对mDRV ZJ99株的RNA抽提物进行RT-PCR扩增,成功地获得了843 bp特异性的扩增片段(GenBank: AY619690)。将PCR产物克隆测序,BLASTn比较结果显示, mDRV ZJ99株σC基因与福建MW9710株对应基因的同源性为98%,与法国89026和89330株对应基因的同源性分别为92%和93%; BLASTp比较结果显示, ZJ99株编码的σC蛋白与MW9710、89026和89330株相应蛋白分别具有94%、89%、 89%同一性(identity)和95%、92%、93%相似性(similarity)。进一步将σC基因亚克隆至原核表达载体pET28a, 转化大肠杆菌(Escherichia coli )BL21(DE3),IPTG诱导阳性重组子,SDS-PAGE电泳检测发现, σC蛋白在大肠杆菌中以包涵体的形式高效表达,目的蛋白的表达量可达到细菌总蛋白的22.9%。
关键词 :
番鸭 ,
呼肠孤病毒 ,
σC蛋白 ,
序列分析 ,
表达
Abstract :The σC gene (GenBank: AY619690) of Muscovy duck reovirus (mDRV) ZJ99 strain was amplified and sequenced with RT-PCR. BLASTn analysis results showed that the σC gene of mDRV ZJ99 had 98% homology to mDRV MW9710 isolated in Fujian Province of China, 92% and 93% homology to mDRV 89026 and mDRV 89330 reported in France. BLASTp analysis showed that the deduced amino acid sequence of ZJ99 had 94%, 89%, 89% identities and 95%, 92%, 93% similarities to that of MW9710, 89026 and 89330, respectively. The σC gene was further subcloned into pET-28a and transformed into Escherichia coli BL21(DE3). SDS-PAGE analysis showed that the σC protein was successfully expressed in E. coli, which existed as inclusion body and accumulated up to 22.9% of total cellular proteins.
Key words :
Muscovy duck reovirus
σC protein
sequence analysis
expression
收稿日期: 2005-02-21
通讯作者:
余旭平
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