牛BoLA-DRB3基因多态性及其序列分析
王兴平 许尚忠 昝林森 陈金宝 高雪
中国农业科学院畜牧研究所；西北农林科技大学动物科技学院 中国农业科学院畜牧研究所 西北农林科技大学动物科技学院 中国农业科学院畜牧研究所 中国农业科学院畜牧研究所
Polymorphism and Sequence Analysis of the exon2 of BoLA-DRB3 in Bovine
摘要 BoLA-DRB3基因是主要组织相容性复合物(Major Histocompatibility Complex, MHC)基因家族中的Ⅱ类基因，它是该基因家族中最主要的功能基因，所编码的MHC抗原与免疫应答，与抗病性密切相关。其第2外显子是编码抗原的主要功能区。本试验采用PCR-RFLP方法对鲁西牛、南阳牛、晋南牛3个群体的DRB3基因第2外显子扩增产物进行多态性分析，检测到A、B和C 3个等位基因，出现6种基因型。χ2适合性检验结果表明鲁西牛和晋南牛在该酶切位点均达到了Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05），而南阳牛未达到Hardy-Weinberg平衡状态（P<0.01）。结合测序，结果显示在DRB3基因第2外显子的第154、155、156和157位的碱基产生突变使得产生HaeⅢ酶切多态。序列比对后发现有13.70％的核苷酸发生突变，相对应有14.61％的氨基酸发生了替代。
关键词 ：
牛 ,
BoLA-DRB3 ,
PCR-RFLP ,
多态性
Abstract ：BoLA-DRB3 is a member of the MHC (Major Histocompatibility Complex), which plays a central role in immune system and disease resistance of bovine. The exon2 of BoLA-DRB3 gene is a mainly functional region, which codes the antigen and participates in the body's immune response. In this study, The restriction polymorphism of the exon2 of BoLA-DRB3 in Luxi，Nanyang and Jinnan cattle were investigated by PCR-RFLP. 6 genotypes and 3 alleles were identified for BoLA-DRB3 locus. Statistical results showed that polymorphism sites at position 154、155、156 and 157 in Luxi catttle and Jinnan cattle fitted Hardy-Weinberg equilibrium, but not in Nanyang cattle. After sequencing, 13.70% of nuclitide mutated, which induced that 14.61％ of amino acid changed.
Key words ：
Bovine
BoLA-DRB3
PCR-RFLP
Polymorphism
收稿日期: 2006-06-06
通讯作者:
许尚忠
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