黄冠梨几丁质酶基因家族cDNA全长序列克隆与分析
刘栋峰1 ,张朝红2 ,王跃进3
1. 陕西省咸阳市杨凌区西北农林科技大学南校区园艺学院58#信箱 2. 西北农林科技大学园艺学院 3. 西北农林科技大学
Full-length cDNA Clone and Sequence Analysis of the Chitinase Family Gene from Pear
2 ,Yue-Jin Wang2
摘要 根据已知植物几丁质酶基因序列的保守区域,设计特异性引物,以梨黄冠品种叶片为材料,提取RNA,进行反转录,克隆获得5个几丁质酶基因cDNA片段,进一步通过RACE技术获得该基因的全长cDNA序列,依次命名为PyChi1、 PyChi2、 PyChi3、 PyChi4、 PyChi5,序列提交GenBanK,登录号为:FJ589783、 FJ589784、 FJ589785 、 FJ589786、FJ589787。序列分析结果表明,所获得5个几丁质酶基因,都具有完整的ORF和Poly(A)结构,与其他植物几丁质酶基因具有较高的相似性;5个基因的核酸序列的同源性约在35%~53%之间,PyChi1和PyChi4的氨基酸同源性最高,约85%,而与PyChi5约77%;在几丁质酶基因家族,分别属于Chitinase ClassesⅠ-Ⅴ,为5个不同类型的成员;不同类型的几丁质酶基因在核酸和氨基酸序列以及功能结构方面都存在着存在着显著的差异,主要表现在肽链特性和基因结构等方面。这为进一步研究梨几丁质酶的结构和功能奠定了基础。
关键词 :
几丁质酶 ,
梨 ,
基因家族 ,
克隆 ,
RACE
Key words :
Chitinase
Pear
Gene family
Clone
RACE
收稿日期: 2009-01-06
通讯作者:
王跃进
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