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2025年8月12日 星期二
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草莓多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因(PGIP)的克隆及组织特异性表达
张勇1,汤浩茹2,侯艳霞2,蒋豪3,罗娅3
1. 四川农业大学
2. 四川农业大学林学园艺学院
3.
Cloning and Tissue Specific Expression of the Polygalacturonase Inhibiting Protein Gene (PGIP) of Fragaria × ananassa
全文: PDF (2840 KB)   HTML (1 KB) 
输出: BibTeX | EndNote (RIS)      
摘要 以草莓(Fragaria × ananassa)叶片为试材,采用PCR技术,克隆到1条多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因,命名为FaPGIP。基因组DNA片段包含一个长为168bp的内含子;cDNA编码区全长999bp,编码332个氨基酸残基。预测该蛋白质分子量为37.1 kDa,等电点为7.67,N端24个氨基酸残基构成的疏水区域为信号肽,具有5个潜在的N-糖基化位点。序列同源比对结果表明,所克隆的FaPGIP基因与GenBank中登录的蔷薇科及其它物种PGIP基因具有较高的同源性。采用SyPred3D软件预测了该基因所编码的蛋白质的三维结构,表明FaPGIP蛋白质的三维模型类似马蹄的结构,含12段α-螺旋和21段β-折叠,中心LRR结构域由10个串联的LRRs基序组成。半定量RT-PCR分析显示,FaPGIP在草莓根、茎、叶、花、果五种组织中均有表达,其表达量为果>叶>花>根>茎,相对表达量分别为0.2460、0.1664、1.3712、0.8721和3.4154。
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作者相关文章
张勇
汤浩茹
侯艳霞
蒋豪
罗娅
关键词 草莓多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因克隆蛋白质结构组织表达    
Abstract:A polygalacturonase inhibiting protein gene named FaPGIP was cloned from strawberry (Fragaria × ananassa) leaves through PCR.The FaPGIP gene from genomic DNA showed a single 168bp intron and the cDNA contained an open reading frame of 999bp, which encoded a polypeptide of 332 amino acid residues with a molecular mass of 37.1 kD and a pI of 7.67, and a hydrophobic region of 24 amino acid residues in the N-terminal which was considered to be a signal peptide. The deduced amino acid sequence contained 5 potential N-glycosylation sites. The sequence homology comparison showed that the FaPGIP exhibits a high homology of the nucleotide sequences with other PGIP genes from the GenBank. The three-dimensional model looked like a horseshoe-shaped structure, and contained 12 α-helices and 21 β-sheets, and the center LRR structural domain was composed of 10 tandem LRRs motifs. The expression of FaPGIP was found in root, stem, leaf, flower and fruit of strawberry. The expression levels in different tissues from fruit, leaf, flower, root and stem ranking high to low, with the relative content of 0.2460, 0.1664, 1.3712, 0.8721and 3.4154, respectively.
Key wordsstrawberry (Fragaria × ananassa)    polygalacturonase inhibiting protein (PGIP)    gene cloning    protein structure    tissue expression
收稿日期: 2009-05-19     
通讯作者: 张勇   
引用本文:   
张勇1,汤浩茹2,侯艳霞2,蒋豪3,罗娅3. 草莓多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因(PGIP)的克隆及组织特异性表达[J]. , 2010, 18(3): 424-430.
链接本文:  
http://journal05.magtech.org.cn/Jwk_ny/CN/     或     http://journal05.magtech.org.cn/Jwk_ny/CN/Y2010/V18/I3/424
 
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