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2025年8月20日 星期三
  2012, Vol. 20 Issue (12): 1414-1423    
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绵羊甘露聚糖结合凝集素基因(MBL)全长DNA序列克隆及生物信息学分析
赵宗胜1,赵凤2,张红梅3,贾斌4,余鹏5,张慧1,班谦2,王建梅2,王小义5
1. 新疆石河子大学动物科技学院
2. 石河子大学动物科技学院
3. 石河子大学医学院第一附属医院
4.
5. 石河子大学生命科学学院
Cloning and Bioinformatics Analysis of Mannan-binding Lectin Gene(MBL) Full-length DNA Sequence in Sheep(Ovis aries)
全文: PDF (2302 KB)   HTML (1 KB) 
输出: BibTeX | EndNote (RIS)      
摘要 绵羊甘露聚糖结合凝集素(MBL)是肌体天然免疫系统的重要组成部分。根据人(Homo sapiens)和牛(Bos taurus)的MBL基因序列的同源保守区域,分段设计9对特异性引物,以中国美利奴羊(Ovis aries)血液基因组DNA为模板,经扩增、测序、拼接,首次克隆到长为4 462 bp 的绵羊MBL基因组DNA序列,包括了该基因的启动子区、4个外显子和3个内含子,编码249个氨基酸;BLAST分析其与牛MBL-C编码的氨基酸同源性最高为96.39 %,判定其为MBL-C型基因,并将该序列提交至GenBank (Accession No. FJ977629);通过Expasy网站预测其蛋白结构功能特征,1~19氨基酸为绵羊MBL基因信号肽区域,外显子1编码N-端富含胱氨酸区和8个Gly-X-Y重复序列的胶原样区,外显子2含有12个Gly-X-Y的胶原样区,外显子4编码的碳水化合物识别域 (CRD)具有C型凝集素CRD的共同特征。本研究为国内首次报道绵羊MBL基因比较完整基因组DNA序列,为深入研究MBL的结构与功能以及MBL缺损的分子机制提供基础数据。
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赵宗胜
赵凤
张红梅
贾斌
余鹏
张慧
班谦
王建梅
王小义
关键词 绵羊甘露聚糖结合凝集素(MBL)序列分析    
Abstract:Sheep mannose-binding lectin(MBL) is an important part of the body's natural immune system. Nine pairs of primers were designed according to human(Homo spiens) and bovine(Bos taurus) MBL gene sequence, combined with PCR technique to amplify the MBL gene of sheep(Ovis aries). Cloning, sequencing and splicing to analyze bioinformations with the DNAMAN software and online tools. The results showed that sequence of DNA of the sheep MBL gene was 4 462 bp containing promoter, four exons, three introns, which encoded 249 animo acids, submitted it to GenBank (Accession No. FJ977629). Its amino acid sequence had an overall similarity with a comparable region of bovine MBL-C gene(96.39%), phylogenetic tree of amino acid analysis indicated that the sheep MBL gene was MBL-C. Expasy were employed to predict specific structure and function of sheep MBL gene, 1~19 amino acids were signal peptide region, exon 1 encoded N-terminus cysteine-rich domain and 8 Gly-X-Y repetitive sequences of collagen-like domain, and exon 4 encoded carbohydrate recognition domain(CRD) which had common features of C-type lectin. This study is the first report about complete genomic DNA sequence data of sheep MBL gene, and it provides basal data for further study on the structure, function and defects in the molecular mechanism of MBL.
Key wordsSheep    Mannose-binding lectin(MBL)    Sequence analysis
收稿日期: 2012-02-02      出版日期: 2018-11-26
基金资助:国家自然科学基金(大黄鱼卵泡抑素基因分子特征及促生长功能分析);科技部国际科技合作项目
通讯作者: 赵宗胜     E-mail: zhengwei890801@sina.com
引用本文:   
赵宗胜 赵凤 张红梅 贾斌 余鹏 张慧 班谦 王建梅 王小义. 绵羊甘露聚糖结合凝集素基因(MBL)全长DNA序列克隆及生物信息学分析[J]. , 2012, 20(12): 1414-1423.
链接本文:  
http://journal05.magtech.org.cn/Jwk_ny/CN/     或     http://journal05.magtech.org.cn/Jwk_ny/CN/Y2012/V20/I12/1414
 
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