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| 低氧分压对牦牛卵丘细胞转录组的影响 |
| 李瑞哲1,2, 徐惊涛2, 孙永刚2, 马志杰2, 陈生梅2, 罗玉柱1,* |
1 甘肃农业大学 动物科学技术学院,兰州 730070;
2 青海省畜牧兽医科学院,西宁 810016 |
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| Effects of Low Oxygen Tension on Transcriptome of Yak (Bos grunniens) Cumulus Cells |
| LI Rui-Zhe1,2, XU Jing-Tao2, SUN Yong-Gang2, MA Zhi-Jie2, CHEN Sheng-Mei2, LUO Yu-Zhu1,* |
1 College of Animal Science and Technology, Gansu Agricultural University, Lanzhou 730070, China;
2 Qinghai Academy of Animal Science and Veterinary Medicine, Xining 810016, China |
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摘要 卵丘细胞是卵母细胞的重要支持细胞,卵丘细胞的质量影响卵母细胞的体外成熟和发育能力。低氧分压有利于牦牛(Bos grunniens)卵母细胞的体外成熟和发育能力,但是卵丘细胞是否参与该作用尚未见报道。为明确低氧分压对牦牛卵丘细胞转录组的影响,本研究在5%和20% O2的条件下进行牦牛卵丘细胞-卵母细胞复合体(cumulus-oocyte complex, COC)成熟培养,然后收集卵丘细胞进行转录组测序、差异表达基因筛选和qRT-PCR验证。本研究共获得8个转录组文库,总数据量56.17 Gb;基因表达分析表明,两组样品中共有13 584个基因得到表达,筛选获得270个差异表达基因,其中229个差异基因在5% O2处理组高表达,41个差异基因在20% O2处理组高表达;基因本体论(Gene Ontology, GO)和KEGG通路富集分析表明,差异表达基因主要富集于糖酵解、卵丘细胞扩散和卵丘细胞-卵母细胞信号传导等生物学过程;在基因组未被注释的区域寻找新基因和新转录本,发现6 711个新基因,7 209个新转录本,其中829个新转录本具有蛋白编码能力。qRT-PCR结果验证了转录组测序结果准确。上述研究结果提示,低氧分压可能促使牦牛卵丘细胞的转录模式趋同于体内成熟环境,进而促进牦牛卵母细胞的成熟并提高其发育能力。本研究结果为深入研究氧分压对牦牛卵母细胞体外成熟中卵丘细胞-卵母细胞互作机理的影响提供了参考依据。
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