转基因水稻DNA样品浓度以及存放条件对PCR定性检测的影响
王渭霞1 ,赖凤香2 ,洪利英2 ,傅强3
1. 中国水稻研究所 2. 3. 杭州体育场路359号,中国水稻研究所
Effects of DNA Concentrations and Storage Conditions on PCR Detection of Transgenic Rice
, , ,
摘要 通过在不同模板DNA浓度(0.2~16 ng/μL)、不同转基因含量(0.05%~50%W/W )以及不同模板存放温度(22℃、4℃和-20℃)和存放时间(1、2、3周和1,3个月)条件下进行转基因水稻外源成分的定性PCR检测,发现当模板浓度在0.4 ng/μL以上时所有引物均能扩增出目标片段,对于转基因含量为1.0%和0.1%的混合样品,能稳定检测出转基因成分所需的DNA最低浓度分别为1和2~4 ng/μL。模板DNA的不同温度存放条件对检测没有明显影响,长时间存放后PCR扩增产物条带亮度有所减弱。
关键词 :
转基因水稻 ,
DNA浓度 ,
PCR ,
转基因检测
Abstract :The effects of DNA concentrations(0.2~16 ng/μL), transgene contents (50.0%~0.05%,W/W), storage temperatures(22℃,4℃,-20℃) and storage periods (1,2,3 weeks and 1, 3 months) on qualitative PCR detection of transgene from transgenic rice(Oryza sativa ssp.indica) were evaluated. The result showed that all the primers can amplified targeted fragment when DNA concentration was higher than 0.4 ng/μL. For mixed samples with 1.0% and 0.1% transgene, the lowest DNA concentration which was still detectable was 1 ng/μL and 2~4 ng/μL, respectively. Sample storage at the three tested different temperatures did not affect subsequent PCR detection. And the brightness of electrophoresis strips of PCR products were gradually weakened after 3 months storage of DNA sample.
Key words :
Transgenic rice
DNA concentration
PCR
Transgene detection
收稿日期: 2009-10-28
通讯作者:
傅强
引用本文:
王渭霞1 ,赖凤香2 ,洪利英2 ,傅强3 . 转基因水稻DNA样品浓度以及存放条件对PCR定性检测的影响[J]. , 2010, 18(5): 846-852.
, , ,. Effects of DNA Concentrations and Storage Conditions on PCR Detection of Transgenic Rice. , 2010, 18(5): 846-852.
链接本文:
http://journal05.magtech.org.cn/Jwk_ny/CN/ 或 http://journal05.magtech.org.cn/Jwk_ny/CN/Y2010/V18/I5/846
[1]
倪鹤嘉, 程雪, 王静, 高泽平, 魏盼盼, 谭佳丽, 孙敬, 李海涛, 高继国. 辽宁省部分地区对鳞翅目害虫高毒力的苏云金芽胞杆菌菌株的分离与筛选 [J]. 农业生物技术学报, 2019, 27(8): 1513-1520.
[2]
谢实龙, 汪小福, 丁晨露, 祝旋, 汤婷, 马同富, 蔡健, 徐俊锋. 转基因大豆MON89788实时荧光重组酶聚合酶扩增检测方法的建立 [J]. 农业生物技术学报, 2019, 27(7): 1301-1310.
[3]
何海健, 吴瑗, 刘正奎, 王志鹏, 陈琳, 王磊, 宋厚辉, 王晓杜. 鉴别猪流行性腹泻病毒基因型的一步法双重qRT-PCR [J]. 农业生物技术学报, 2019, 27(7): 1311-1321.
[4]
陈昌龙, 赵雪, 孙旺旺, 李晓颖, 田宇, 李未然, 谢华. 大白菜软腐病抗性相关基因分子标记的开发 [J]. 农业生物技术学报, 2019, 27(6): 982-992.
[5]
钱正, 张四杰, 金有权, 张新凤. 柳叶蜡梅叶和花转录组测序及香气合成差异基因的筛选和表达 [J]. 农业生物技术学报, 2019, 27(5): 844-855.
[6]
林裕胜, 李莎莎, 江锦秀, 张靖鹏, 游伟, 胡奇林. 绵羊肺炎支原体和丝状支原体山羊亚种双重TaqMan探针荧光定量PCR检测方法的建立及应用 [J]. 农业生物技术学报, 2019, 27(5): 943-950.
[7]
朱丰晓, 陈家璐, 张智俊. 竹花叶病毒SYBR GreenⅡ 反转录实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用 [J]. 农业生物技术学报, 2019, 27(4): 752-760.
[8]
刘东让, 侯喜林, 肖栋. 不结球白菜抗病相关基因BcSGT1 的克隆及表达分析 [J]. 农业生物技术学报, 2019, 27(3): 402-410.
[9]
高鸿蒙, 张秀英, 张慧泽, 哈斯其木格, 周旭光, 魏健民, 于中正. 乌珠穆沁羊LPL 基因第3外显子多态性与肉质性状的关联分析 [J]. 农业生物技术学报, 2019, 27(3): 449-456.
[10]
杨大鹏, 何玉琴, 葛闻博, 张全伟, 华道才让, 王霞, 周凯仁, 陈卫刚. 甘加藏羊发情周期下丘脑-垂体-卵巢轴中MTR1a 基因的表达分析 [J]. 农业生物技术学报, 2019, 27(3): 457-463.
[11]
沈肖玲, 易建平, 王荣洲, 钱俊婷, 李艳敏, 姚海峰, 楼兵干. 甘薯茎腐病菌TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立与应用 [J]. 农业生物技术学报, 2019, 27(3): 551-563.
[12]
陈翠腾, 陈珍, 朱春华, 蔡国漳, 刘斌琼, 黄瑜. 鸭腺病毒3型MGB TaqMan探针实时荧光定量PCR检测方法的建立 [J]. 农业生物技术学报, 2019, 27(3): 564-570.
[13]
申雪静, 张二芹, 许倩茹, 刘林科, 万博, 刘运超, 孙亚宁, 赵东, 牛香香, 邓瑞广, 张改平. 狂犬病病毒G蛋白在水稻中的表达及遗传稳定性鉴定 [J]. 农业生物技术学报, 2019, 27(2): 204-211.
[14]
刘燕, 袁律峰, 季权安, 韦强, 肖琛闻, 李科, 黄叶娥, 鲍国连. 冷应激对兔波氏杆菌感染传播的影响 [J]. 农业生物技术学报, 2019, 27(2): 307-314.
[15]
张雪, 王荔, 瞿飞, 杨胜俊. 红梨实时荧光定量PCR内参基因的筛选 [J]. 农业生物技术学报, 2019, 27(2): 361-370.