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我国荷斯坦种公牛个体识别和亲子鉴定DNA数据库的建立
刘刚1,刘丑生李宁3,韩旭1,王静
Establishment of DNA Database for Individual Identification and Parentage Analysis Using Microsatellites in Chinese Hostein Bulls(Bos taurus)
全文: PDF (620 KB)   HTML (1 KB) 
输出: BibTeX | EndNote (RIS)      
摘要 为了构建我国荷斯坦种公牛个体及亲子鉴定DNA数据库,本研究从联合国粮农组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)推荐的具有高度多态性的微卫星标记中选取11个常染色体微卫星标记(BM1824、BM2113、ETH3、ETH10、ETH225、INRA023、SPS115、TGLA53、TGLA122、TGLA126和TGLA227)以及4个自选的Y染色体微卫星标记(MAF45、MCM158、UNM0108和UMN0929),采用荧光引物PCR和ABI3130遗传分析仪,对2 150头荷斯坦种公牛(Bos taurus)个体基因型进行了检测,并探讨其用于牛个体识别和亲子鉴定的可行性。研究结果表明:15个微卫星标记平均杂合度为0.766,平均多态信息含量为0.738,其中MCM158标记平均多态信息含量最高为0.866,SPS115标记最低为0.588,均属于高多态性标记。15个标记累积个体识别能力为99.99%,累积非父排除率达到99.99%,随机个体一致性概率为1.62×10-17。研究结果表明上述15个微卫星标记进行个体识别和亲子鉴定的效力与可靠性均很高,同时初步建立了荷斯坦种公牛DNA数据库。从而使个体识别和亲子鉴定程序标准化、统一化和简便化。
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刘刚
刘丑生李宁
韩旭
王静
关键词 种公牛DNA数据库个体识别亲子鉴定    
Abstract:To establish DNA database for individual identification and parentage analysis system in Chinese Hostein bulls, eleven microsatellites(BM1824、BM2113、ETH3、ETH10、ETH225、INRA023、SPS115、TGLA53、TGLA122、TGLA126 and TGLA227)recommend by International Society of Animal Genetics(ISAG) and four microsatellites(MAF45、MCM158、UNM0108 and UMN0929) selected in Y chromosome were used to examine 2 150 Holstein bulls(Bos taurus) with fluorescence primer PCR and genetic analysis equipment of ABI3130, discussing feasibility on individual identification and parentage testing in cattle. Results showed that mean of heterozygosity was 0.766 and polymorphism information content(PIC) with 0.738 in 15 microsatellites markers. Largest mean of PIC in MCM158 marker was 0.866, and lowest mean of PIC in SPS115 marker was 0.588, belonging to high polymorphism markers. Combined power of discrimination, combined power of exclusion and probability of identity of 15 microsatellites markers were 99.99%, 99.99% and 1.62×10-17, respectively. Therefore, effectiveness and reliability of 15 microsatellites markers were high for individual identification and parentage analysis. In addition, DNA database for individual and parentage identification was established in this study, and progress was made in the standardization, normalization and simplification for individual identification and parentage analysis.
Key wordsDNA database of bull    Individual identification    Parentage testing
收稿日期: 2013-03-06     
通讯作者: 刘丑生   
引用本文:   
刘刚1,刘丑生李宁3,韩旭1,王静. 我国荷斯坦种公牛个体识别和亲子鉴定DNA数据库的建立[J]. , 2013, 21(9): 1085-1092.
链接本文:  
http://journal05.magtech.org.cn/Jwk_ny/CN/     或     http://journal05.magtech.org.cn/Jwk_ny/CN/Y2013/V21/I9/1085
 
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