拟南芥抗致病疫霉突变体T-DNA 侧翼序列分析
毛娜 刘颖超 董金皋
河北农业大学 河北农业大学 河北农业大学
Analysis T-DNA flanking sequence of Arabidopsis thaliana mutants of resistant to Phytophthora infestans
摘要 本文通过将致病疫霉不同菌株接种到拟南芥Col-0生态型激活标签突变体上,筛选出了感致病疫霉的类型,以筛选出的拟南芥感病突变体基因组DNA为模板,利用热不对称交错PCR方法(Thermal asymmetric interlaced PCR,TAIL-PCR),进行了抗性相关基因的研究。通过TAIL-PCR技术,获得了拟南芥T-DNA插入侧翼序列,利用拟南芥基因组全测序的优势,通过NCBI进行序列的同源性比对找到相应的基因。结果发现,TAIL-PCR可以有效地扩增T-DNA插入侧翼拟南芥基因组序列,AD1,AD2,和AD4是最佳随机引物。对8个TAIL-PCR特异产物测序分析,证明3个T-DNA插入在基因上。
关键词 :
拟南芥 ,
致病疫霉 ,
激活标签 ,
TAIL-PCR
Abstract :Several Phytophthora infestans-susceptible mutants had been obtained based on the different reactions of Arabidopsis activated tagging mutants after being inoculated by the fungus, and flanking sequence of Arabidopsis T-DNA insertion had also been obtained by TAIL-PCR technology and genomic DNA from disease-susceptible mutants as template. Some disease resistant-related genes had been found using NCBI sequence homology analysis and AD1,AD2 and AD4 were the most efficient arbitary primers. Two mutants had been found with T-DNA insertion through sequencing and analyzing eight specific TAIL-PCR products.
Key words :
Arabidopsis thaliana
Phytophthora infestans
activating tagging
TAIL-PCR
收稿日期: 2006-10-26
通讯作者:
董金皋
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