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2025年8月5日 星期二
  2015, Vol. 23 Issue (7): 940-944    
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基于线粒体基因组D-loop区全序列分析安义瓦灰鸡遗传多样性及其起源进化关系
高玉时,贾晓旭,唐修君,唐梦君,樊艳凤,陆俊贤,顾荣,葛庆联,苏一军
江苏省家禽科学研究所
The Genetic Diversity and Origin Analysis of Anyi Tile-like Chickens (Gallus gallus domestiaus) Based on Mitochondrial DNA D-loop Sequence
全文: PDF (978 KB)   HTML (1 KB) 
输出: BibTeX | EndNote (RIS)      
摘要 本研究旨在探究江西安义瓦灰鸡(Gallus gallus domestiaus)的遗传多样性和起源。对30只安义瓦灰鸡线粒体基因组(mitochondrial genome, mtDNA) D-loop区全序列的进行PCR扩增和测序(GenBank登录号: KP893677~KP893682),并结合GenBank中红色原鸡的D-loop区序列,分析安义瓦灰鸡线粒体多态性及其起源。结果发现,安义瓦灰鸡 mtDNA D-loop区全长1 231~1 232 bp,核苷酸多样性(Pi)为(0.006 13±0.000 14),单倍型多样性(Hd)为(0.837±0.027)。在30只个体中,共发现18处单核苷酸多态位点,6种单倍型。系统发育分析发现,6种单倍型可以分为A、B、C 3个分支,其中C为主要分支,有3种单倍型,A分支有1种倍型,B分支有2种倍型。A和B分支与红色原鸡滇南亚种(Gallus gallus spadiceus)聚为一类, C分支与4个原鸡亚种聚为一类。研究结果表明,安义瓦灰鸡mtDNA D-loop区有丰富的多态性,并且有多个母系起源,从分子水平上为安义瓦灰鸡的遗传资源保护和开发利用提供了参考。
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高玉时
贾晓旭
唐修君
唐梦君
樊艳凤
陆俊贤
顾荣
葛庆联
苏一军
关键词 安义瓦灰鸡线粒体DNAD-loop区系统发育关系起源    
Abstract:This study sought to assess mitochondrial DNA (mtDNA) diversity and origin of Jiangxi Anyi Tile-like Chickens(Gallus gallus domestiaus). Blood samples were collected from 30 chickens. The complete sequence of the mtDNA D-loop was PCR amplified and subsequently sequenced (Genbank accession No.KP893677~KP893682.). DNA sequence of mtDNA D-loop of five red jungle fowl subspecies were collected from the GenBank and used as reference sequences. The results showed that, the D-loop region of Anyi Tile-like Chickens was 1 231~1 232 bp in length. The nucleotide diversity was (0.006 13±0.000 14), and the haplotype diversity was (0.837±0.027). The 6 haplotypes were observed based on 18 mutant site and clustered into three clades (A, B, and C), of which clade C was dominant. Three haplotypes belong to clade C, two haplotypes are in clade B, one is in clade A. The clade A and clade B were clustered with Gallus gallus spadiceus, clade C was clustered with four subspecies of red jungle fowl. These results show a high mitochondrial D-loop diversity and indicate multiple maternal origins for Anyi Tile-like Chickens. The results in this study will be a reference for conservation and utilization of Anyi Tile-like Chickens.
Key wordsAnyi Tile-like Chickens    Mitochondrial DNA    D-loop region    Phylogenetic relationship    Origin
收稿日期: 2014-12-30      出版日期: 2015-05-13
基金资助:基于线粒体多基因的鸡种质鉴定的DNA编码研究
通讯作者: 高玉时     E-mail: gaoys100@sina.com
引用本文:   
高玉时 贾晓旭 唐修君 唐梦君 樊艳凤 陆俊贤 顾荣 葛庆联 苏一军. 基于线粒体基因组D-loop区全序列分析安义瓦灰鸡遗传多样性及其起源进化关系[J]. , 2015, 23(7): 940-944.
链接本文:  
http://journal05.magtech.org.cn/Jwk_ny/CN/     或     http://journal05.magtech.org.cn/Jwk_ny/CN/Y2015/V23/I7/940
 
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